Des spéciaux très dangereux du niveau souterrain 5 du bâtiment de Primatech se sont évadés grâce à Sylar. Angela Petrelli, nouvelle dirigeante de la Compagnie, n'hésite pas à le recruter pour faire face, tandis qu'un ennemi qu'elle croyait mort réapparait : son mari, Arthur Petrelli, qui veut reprendre le contrôle en créant une substance qui donnerait des pouvoirs à tout homme normal et veut utiliser son fils Nathan pour devenir la vitrine de son projet...